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ncrna数据库 人microRNA检测

时间:2023-11-06字号:

微动态学转染后靶基因的mrna会减少吗?microRNAs(miRNA)是一种小的单链RNA,大小约为2123个碱基,是由一种具有发夹结构的单链RNA前体经Dicer酶加工后产生的,大小约为7090个碱基。它不同于siRNA(双链),但与siRNA密切相关。

microrna数据库

1、...我这里有期末考试题,熟悉PDB数据库、蛋白质序列、mRNA

2、rNTP是什么?

riboNTP,核糖核苷三磷酸。RNA曾被认为只是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚地表明,RNA在生命过程中发挥的作用远比我们早先认为的重要。RNA干扰的发现使人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,由于它可以简化/替代基因敲除,成为研究基因功能的有力工具,因此格外引人注目,RNAi在2002年《科学》评选的10大科学成就中名列第一。

3、miRBase中收录的miRNA都是实验验证的吗

1,starBase,一个由高通量实验数据CLIPSeq(或HITSCLIP,PARCLIP,iCLIP)和mRNA degradome测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了mirna,miRNAlncRNA,miRNAcircRNA,miRNAmRNA RNAprotein的调控关系。整合构建几种流行的目标预测软件的交集和调控关系。

2.miRbase知名的microRNA基因注释数据库。目前,miRBase只提供了microRNA靶点预测软件(如PicTar)的链接。最新发布日期:2010年9月。3.ChIPBase整合了CLIPSeq和ChIPSeq的数据,探索microRNA的转录和转录后调控,构建了转录因子> microRNA >靶标的调控网络。

4、lncRNA和microRNA、smallRNA的关系从定义,特别是长度、作用、产物来...

你说的三种都是非编码RNA,不编码蛋白质。小RNA通常用于描述在细菌中发现的那些microRNA,但它也用于描述其他物种的非编码RNA,如microRNA、SiRNA、SnRNA等。,一般长度为2030个核苷酸。MicroRNA是一种小RNA,长度约22个核苷酸,通过靶向3 UTR抑制或降解目的基因的表达。

5、microRNA的qPCR内参可以用GAPDH吗

miRNA的荧光定量pcr可以使用肌动蛋白作为内参。Mirna可以通过与转录物的相互作用来关闭或抑制基因表达。最近的研究表明,它们影响大约30%的基因。MiRNA在许多组织中差异表达,这使得表达谱的分析成为研究的热点。同时,miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。我知道和使用的u6参照基因只有两个:RNU61和RNU62。前者就是常见的U6。

u6的表达水平有点偏高,u6b的Cq值接近我的目标miRNA,稳定性较好,但这些对植物样本中参考基因的选择没有指导意义。为了确定u6在植物中的保守性,一个快速的方法是找到关于该主题的文献综述。如果没有人写过这样的综述,那就只能自己去找数据库里所有的序列进行对比了。关于参考基因的选择,需要通过实验确定特定样品中的表达水平是稳定的。

6、同一microrna在不同细胞中对同一基因会不会起不同调控作用

同一个microrna在不同细胞中对同一个基因会有不同的调控作用吗?MicroRNA(miRNA)是大小约为2123个碱基的单链小分子RNA,由大小约为7090个碱基的发夹结构的单链RNA前体经Dicer酶处理生成,与siRNA(双链)不同,但与siRNA关系密切。推测这些非编码小RNA(miRNA)参与基因表达的调控,但机制与siRNA接收的mRNA降解不同。

7、预测一个转录因子可以调控哪些microrna的表达

一半的转录因子与受调控基因的启动子区结合。我们可以做一个chipseq实验,然后在基因组数据库中定位这些与转录因子结合的DNA区域。那么这些区域下游附近的基因很可能是受转录因子调控的基因。然后检测转录因子KO后这些疑似基因的mRNA水平(realtimePCR)来确定它们是否受其调控。

8、哪些mirna对ppar

1,starBase,一个由高通量实验数据CLIPSeq(或HITSCLIP,PARCLIP,iCLIP)和mRNA degradome测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了mirna,miRNAlncRNA,miRNAcircRNA,miRNAmRNA RNAprotein的调控关系。整合构建几种流行的目标预测软件的交集和调控关系。

2.miRbase知名的microRNA基因注释数据库。目前,miRBase只提供了microRNA靶点预测软件(如PicTar)的链接。最新发布日期:2010年9月。3.ChIPBase整合了CLIPSeq和ChIPSeq的数据,探索microRNA的转录和转录后调控,构建了转录因子> microRNA >靶标的调控网络。

9、转染micrornamimics之后靶基因mrna会降低吗

micrornamics(mirnas),一种小的单链RNA,大小约2123个碱基,由一种发夹结构的单链RNA前体经Dicer酶处理产生,约7090个碱基,与siRNA(双链)不同,但与siRNA密切相关。推测这些非编码小RNA(miRNA)参与基因表达的调控,但机制与siRNA接收的mRNA降解不同。

MiRNA由高等生物的基因组编码,导致沉默复合物(RISC)降解mRNA或通过与靶基因mRNA的碱基配对来阻碍其翻译。在物种进化中总是相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,mirnas的组织特异性和时机决定了组织和细胞的功能特异性,表明mirnas在细胞生长发育的调控中具有多种功能。

关键词:数据库 ncrna

文章标题: ncrna数据库 人microRNA检测
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